Uma das primeiras culturas trabalhadas pelo Iapar foi o café.
Com a crise de preços no início da década de 1970, muitos produtores tiveram sérios prejuízos. Uma das consequências foi a desistência de muitos cafeicultores que, sem esperança, mudaram de atividade. Para aqueles que persistiram, uma das alternativas colocada pelo pesquisadores do Iapar foi iniciar pesquisas com cafés de melhor qualidade e menos suscetíveis às intempéries. O objetivo desses projetos era conquistar o mercado de cafés de qualidade, o que garantiria bons preços.
Somado a isso, para melhorar ainda mais o potencial de produção das lavouras paranaenses, todo o sistema cafeeiro do Estado foi transformado com a ajuda do Iapar. Uma das primeiras indicações da entidade foi acabar com a monocultura do café, abrindo espaço para rotação com outras culturas, como soja e milho.